linux libbz2.so.1,libbz2.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or directory

在解决这个报错的过程中，我学到了Linux下解决问题的一种新思路。这个报错很早之前就遇到过，当时是用自己安装的miniconda来下载安装samtools(非root用户)，安装完成之后运行就这样报错了，但是其他的软件又可以正常运行，比如bwa。今天安装deeptools，也是这个情况：成功安装了，就是无法运行，显示缺文件。

我在/usr/lib64/文件夹下面找了找，看到了类似的文件

$ cd /usr/lib64/

$ ll libbz2*

lrwxrwxrwx. 1 root root 11 Aug 30 2018 libbz2.so -> libbz2.so.1

lrwxrwxrwx. 1 root root 15 Aug 30 2018 libbz2.so.1 -> libbz2.so.1.0.6

-rwxr-xr-x. 1 root root 67K Nov 20 2015 libbz2.so.1.0.6

这几个文件(其实只有一个libbz2.so.1.0.6)和我们需要的libbz2.so.1.0名称很相似，猜测作用应该是一样的，能不能软链接一下？肯定是不行的，非root用户没有权限在/usr/lib64/这种目录下面瞎搞。

$ ln -s libbz2.so.1 libbz2.so.1.0

ln: failed to create symbolic link ‘libbz2.so.1.0’: Permission denied

不过我有个办法，就是把/usr/lib64/下面的这几个文件拷贝到自己的目录下面，这样就能肆意盘它了。问题又来了，拷贝到哪个目录下面？我放到了mypath/miniconda3/lib下面，因为既然目录名称都叫"lib"，说明存放的文件类别相同，并且我在mypath/miniconda3/lib下面也找到了很多lib*so*这样的文件。

$ cp libbz2.so.1 ~/miniconda3/lib

接着在mypath/miniconda3/lib目录下面软链接或是改名称

$ cd ~/miniconda3/lib

$ ln -s libbz2.so.1 libbz2.so.1.0

$ ll libbz2*

-rwxr-xr-x. 1 huangsiyuan grp3 67K Jul 9 19:39 libbz2.so.1

lrwxrwxrwx. 1 huangsiyuan grp3 11 Jul 9 19:43 libbz2.so.1.0 -> libbz2.so.1

再运行bamCoverage或是samtools就没问题了

总结

以上是生活随笔为你收集整理的linux libbz2.so.1,libbz2.so.1.0: cannot open shared object file: No such file or directory的全部内容，希望文章能够帮你解决所遇到的问题。

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