知识图谱实践篇(四):Apache jena SPARQL endpoint及推理
在上一篇我们学习了如何利用D2RQ来开启endpoint服务,但它有两个缺点:
1. 不支持直接将RDF数据通过endpoint发布到网络上。
2. 不支持推理。
这次我们介绍的Apache Jena能够解决上面两个问题。
一、Apache Jena简介
Apache Jena(后文简称Jena),是一个开源的Java语义网框架(open source Semantic Web Framework for Java),用于构建语义网和链接数据应用。下面是Jena的架构图:
本次实践我们会用到的组件有:TDB、rule reasoner和Fuseki。
1. TDB是Jena用于存储RDF的组件,是属于存储层面的技术。在单机情况下,它能够提供非常高的RDF存储性能。目前TDB的最新版本是TDB2,且与TDB1不兼容。
2. Jena提供了RDFS、OWL和通用规则推理机。其实Jena的RDFS和OWL推理机也是通过Jena自身的通用规则推理机实现的。
3. Fuseki是Jena提供的SPARQL服务器,也就是SPARQL endpoint。其提供了四种运行模式:单机运行、作为系统的一个服务运行、作为web应用运行或者作为一个嵌入式服务器运行。
Jena目前是使用最广泛、文档最全、社区最活跃的一个开源语义网框架。更多的细节,读者可以参考官方文档。
二、Fuseki与OWL推理实战
我们先下载Jena的最新版本(fuseki和其他的功能模块不在同一个文件中,需要分别下载apache-jena和apache-jena-fuseki)。后续操作以Windows为例,Linux类似,只是脚本位置不同。
创建一个目录(我这里命名为“tdb”)用于存放tdb数据。进入“apache-jena-X.X.X”文件夹的bat目录,可以看到很多批处理文件,我们使用“tdbloader.bat”将之前我们的RDF数据以TDB的方式存储。命令如下:
.\tdbloader.bat --loc="D:\apache jena\tdb" "D:\d2rq\kg_demo_movie.nt"“--loc”指定tdb存储的位置,即刚才我们创建的文件夹;第二个参数是由Mysql数据转换得到的RDF数据。
进入入“apache-jena-fuseki-X.X.X”文件夹,运行“fuseki-server.bat”,然后退出。程序会为我们在当前目录自动创建“run”文件夹。将我们的本体文件“ontology.owl”移动到“run”文件夹下的“databases”文件夹中,并将“owl”后缀名改为“ttl”。在“run”文件夹下的“configuration”中,我们创建名为“fuseki_conf.ttl”的文本文件(取名没有要求),加入如下内容:
@prefix : <http://base/#> . @prefix tdb: <http://jena.hpl.hp.com/2008/tdb#> . @prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> . @prefix ja: <http://jena.hpl.hp.com/2005/11/Assembler#> . @prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> . @prefix fuseki: <http://jena.apache.org/fuseki#> .:service1 a fuseki:Service ; fuseki:dataset <#dataset> ; fuseki:name "kg_demo_movie" ; fuseki:serviceQuery "query" , "sparql" ; fuseki:serviceReadGraphStore "get" ; fuseki:serviceReadWriteGraphStore "data" ; fuseki:serviceUpdate "update" ; fuseki:serviceUpload "upload" .<#dataset> rdf:type ja:RDFDataset ;ja:defaultGraph <#model_inf> ;.<#model_inf> a ja:InfModel ;ja:baseModel <#tdbGraph> ;#本体文件的路径ja:content [ja:externalContent <file:///D:/apache%20jena/apache-jena-fuseki-3.5.0/run/databases/ontology.ttl> ] ;#启用OWL推理机ja:reasoner [ja:reasonerURL <http://jena.hpl.hp.com/2003/OWLFBRuleReasoner>] .<#tdbGraph> rdf:type tdb:GraphTDB ;tdb:dataset <#tdbDataset> ;.<#tdbDataset> rdf:type tdb:DatasetTDB ;tdb:location "D:/apache jena/tdb" ;.
再次运行“fuseki-server.bat”,如果出现如下界面表示运行成功:
Fuseki默认的端口是3030,浏览器访问“http://localhost:3030/”, 和之前介绍的D2RQ web界面类似,我们可以进行SPARQL查询等操作。在Python中用SPARQLWrapper向Fuseki server发送查询请求:
PREFIX : <http://www.kgdemo.com#> PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>SELECT * WHERE { ?x :movieTitle '功夫'. ?x ?p ?o. }即查询电影《功夫》的所有属性。返回的结果:
x p o file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#genre/14 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#genre/28 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#genre/35 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#genre/80 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#type http://www.kgdemo.com#Movie file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieRating 7.2E0 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieIntroduction 1940年代的上海,自小受尽欺辱的街头混混阿星(周星驰)为了能出人头地,可谓窥见机会的缝隙就往里钻,今次他盯上行动日益猖獗的黑道势力“斧头帮”,想借之大名成就大业。 阿星假冒“斧头帮”成员试图在一个叫“猪笼城寨”的地方对居民敲诈,不想引来真的“斧头帮”与“猪笼城寨”居民的恩怨。“猪笼城寨”原是藏龙卧虎之处,居民中有许多身怀绝技者(元华、梁小龙等),他们隐藏于此本是为远离江湖恩怨,不想麻烦自动上身,躲都躲不及。而在观战正邪两派的斗争中,阿星逐渐领悟功夫的真谛。 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieTitle 功夫 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieReleaseDate 2004-02-10 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#type http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/25251 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/57609 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/118745 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/57607 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/65975 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/78878 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/83635 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/119426 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/545277 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/576408 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1136808 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1173200 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1173216 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1173223 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1173224 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1287732 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasActor file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1676386 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#type http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#Resource file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470 http://www.w3.org/2002/07/owl#sameAs file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#movie/9470电影的“hasActor”属性是通过OWL推理机得到的,即我们原本的RDF数据里面是没有的。可以在D2RQ的endpoint中进行同样的查询,得到如下结果:
x p o http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieRating 7.2E0 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieIntroduction 1940年代的上海,自小受尽欺辱的街头混混阿星(周星驰)为了能出人头地,可谓窥见机会的缝隙就往里钻,今次他盯上行动日益猖獗的黑道势力“斧头帮”,想借之大名成就大业。 阿星假冒“斧头帮”成员试图在一个叫“猪笼城寨”的地方对居民敲诈,不想引来真的“斧头帮”与“猪笼城寨”居民的恩怨。“猪笼城寨”原是藏龙卧虎之处,居民中有许多身怀绝技者(元华、梁小龙等),他们隐藏于此本是为远离江湖恩怨,不想麻烦自动上身,躲都躲不及。而在观战正邪两派的斗争中,阿星逐渐领悟功夫的真谛。 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre http://localhost:2020/resource/genre/14 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre http://localhost:2020/resource/genre/28 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre http://localhost:2020/resource/genre/35 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#hasGenre http://localhost:2020/resource/genre/80 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieReleaseDate 2004-02-10 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.kgdemo.com#movieTitle 功夫 http://localhost:2020/resource/movie/9470 http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#type http://www.kgdemo.com#Movie这些是真实存在于“kg_demo_movie.nt”的数据。
三、规则推理实战
在“databases”文件夹下新建一个文本文件“rules.ttl”,填入如下内容:
@prefix : <http://www.kgdemo.com#> . @prefix owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#> . @prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> . @prefix xsd: <XML Schema> . @prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .[ruleComedian: (?p :hasActedIn ?m) (?m :hasGenre ?g) (?g :genreName '喜剧') -> (?p rdf:type :Comedian)] [ruleInverse: (?p :hasActedIn ?m) -> (?m :hasActor ?p)]我们定义了一个名为“ruleComedian”的规则,它的意思是:如果有一个演员,出演了一部喜剧电影,那么他就是一位喜剧演员。修改配置文件“fuseki_conf.ttl”:
@prefix : <http://base/#> . @prefix tdb: <http://jena.hpl.hp.com/2008/tdb#> . @prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> . @prefix ja: <http://jena.hpl.hp.com/2005/11/Assembler#> . @prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> . @prefix fuseki: <http://jena.apache.org/fuseki#> .:service1 a fuseki:Service ; fuseki:dataset <#dataset> ; fuseki:name "kg_demo_movie" ; fuseki:serviceQuery "query" , "sparql" ; fuseki:serviceReadGraphStore "get" ; fuseki:serviceReadWriteGraphStore "data" ; fuseki:serviceUpdate "update" ; fuseki:serviceUpload "upload" .<#dataset> rdf:type ja:RDFDataset ;ja:defaultGraph <#model_inf> ;.<#model_inf> a ja:InfModel ;ja:baseModel <#tdbGraph> ;#本体文件的路径ja:content [ja:externalContent <file:///D:/apache%20jena/apache-jena-fuseki-3.5.0/run/databases/ontology.ttl> ] ;#关闭OWL推理机#ja:reasoner [ja:reasonerURL <http://jena.hpl.hp.com/2003/OWLFBRuleReasoner>] .#开启规则推理机,并指定规则文件路径ja:reasoner [ja:reasonerURL <http://jena.hpl.hp.com/2003/GenericRuleReasoner> ; ja:rulesFrom <file:///D:/apache%20jena/apache-jena-fuseki-3.5.0/run/databases/rules.ttl> ; ].<#tdbGraph> rdf:type tdb:GraphTDB ;tdb:dataset <#tdbDataset> ;.<#tdbDataset> rdf:type tdb:DatasetTDB ;tdb:location "D:/apache jena/tdb_for_demo" ;.我们只能启用一种推理机。前面也提到,OWL的推理功能也可以在规则推理机里面实现,因此我们定义了“ruleInverse”来表示“hasActedIn”和“hasActor”的相反关系。更多细节读者可以参考文档。
我们执行如下SPARQL查询,喜剧演员有哪些:
PREFIX : <http://www.kgdemo.com#> PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>SELECT * WHERE { ?x rdf:type :Comedian. ?x :personName ?n. } limit 10查询结果:
x n file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/111298 郑丹瑞 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/70591 陈欣健 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/116351 沈殿霞 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/116052 鲍汉琳 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1002925 张同祖 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/62423 林正英 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1614091 林琪欣 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/224929 陈法蓉 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/1135398 叶世荣 file:///D:/d2rq/d2rq-0.8.1/kg_demo_movie.nt#person/119426 元秋
四、总结
本次实践介绍了如何使用Jena来开启endpoint服务,提供高效的查询;并介绍了如何加入推理引擎。我们是用Jena提供的命令行工具来完成上述操作。实际上,jena提供了所有工具的API接口,读者可以用Java编写程序,进行开发。相关文件已上传至github。另外,下一篇文章是实践篇的最后一篇,我们会结合前面的练习,介绍如何实现一个简易的问答程序。
https://zhuanlan.zhihu.com/p/33224431
总结
以上是生活随笔为你收集整理的知识图谱实践篇(四):Apache jena SPARQL endpoint及推理的全部内容,希望文章能够帮你解决所遇到的问题。
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