表观遗传小白逆袭之道:从这 19 个视频开始吧!
在过去的一段时间,我们陆续发布了 19 期「表观遗传系列视频」的推送。
发布系列视频的时候其实内心还蛮忐忑的,这种重复的推送模式可能会让读者感到厌倦,但是我们知道必须要坚持推送完。我们期待达到这样的效果:当我们希望了解表观遗传的某个细分领域时,我们可以快速、准确地找到相应的视频,在很短时间内对这个领域有比较全面的掌握。掌握了这些大牛提供的理论后,可以比对易生信的课程,加强实战(见文后)。
本系列视频涵盖表观遗传相关的细分领域:3D 基因组、DNA 甲基化及其动态调控、增强子调控、非编码 RNA(包括 miRNA、环形 RNA 等)、DNA 6mA 修饰、RNA 修饰、染色质修饰与可变剪接,生物信息学分析(ChIP-Seq & RNA-Seq),以及表观基因组学常用的方法学和数据库/网站(ENCODE & Roadmap)介绍等。
为了进一步方便小伙伴们检索和观看,现将这 19 个视频梳理如下(点击相应图片即可直接进入相应的视频页面):
ChIP-seq专题
ChIP-seq基本分析流程
从Richard Young教授的系列研究看超级增强子发现背后的故事 (附超级增强子鉴定代码)
了解完理论,来实战下?
R统计和作图
在R中赞扬下努力工作的你,奖励一份CheatShet
别人的电子书,你的电子书,都在bookdown
R语言 - 入门环境Rstudio
R语言 - 热图绘制 (heatmap)
R语言 - 基础概念和矩阵操作
R语言 - 热图简化
R语言 - 热图美化
R语言 - 线图绘制
R语言 - 线图一步法
R语言 - 箱线图(小提琴图、抖动图、区域散点图)
R语言 - 箱线图一步法
R语言 - 火山图
R语言 - 富集分析泡泡图
R语言 - 散点图绘制
R语言 - 韦恩图
R语言 - 柱状图
R语言 - 图形设置中英字体
R语言 - 非参数法生存分析
R语言 - 绘制seq logo图
WGCNA分析,简单全面的最新教程
一文看懂PCA主成分分析
富集分析DotPlot,可以服
基因共表达聚类分析和可视化
R中1010个热图绘制方法
还在用PCA降维?快学学大牛最爱的t-SNE算法吧, 附Python/R代码
一个函数抓取代谢组学权威数据库HMDB的所有表格数据
文章用图的修改和排版
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network3D 交互式网络生成
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总结
以上是生活随笔为你收集整理的表观遗传小白逆袭之道:从这 19 个视频开始吧!的全部内容,希望文章能够帮你解决所遇到的问题。
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