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如何降低下一代测序1%的碱基错误识别?

发布时间:2023/11/24 60 博士
生活随笔 收集整理的这篇文章主要介绍了 如何降低下一代测序1%的碱基错误识别? 小编觉得挺不错的,现在分享给大家,帮大家做个参考.
楼上提到的双重测序可能不会代替标准方法。其中一个原因是,对于全外显子组测序来说,这种方法过于昂贵。它对于细胞的测序不均匀混合物或提问的生物学问题,真的很有用,因为它们需要超级精确度。所以,从某种意义上说,双重测序可能会被限制在癌症研究、病毒群、古DNA取证之类的事情。”

之前在某一篇文章见过这种方法,具体我不是很清楚,称之为双重测序(Duplex Sequencing),相关研究结果发表在2012年的《PNAS》杂志。通过对DNA双链体的两条链进行独立标记和测序,这种方法实现的理论背景误差率为,小于每十亿个核苷酸序列中有1个人为突变。因此,这种方法对于检测罕见DNA变异以及单分子计数具有很高的灵敏度,可精确地确定DNA或RNA拷贝数的绝对值。

目前降低下一代测序技术碱基出错的方法主要有两个方面:1、双重测序——降低误差率2、添加金属螯合剂降低DNA氧化偏差——实现精确度具体可参见:http://www.51atgc.com/xingyezi ... .html

总结

以上是生活随笔为你收集整理的如何降低下一代测序1%的碱基错误识别?的全部内容,希望文章能够帮你解决所遇到的问题。

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