大家来盘点最热门的基因组测序新成果吧

种属：南极蠓（Belgica antarctica）基因组：99 million bp南极蠓是南极洲唯一一种完全陆生的本土动物，南极蠓测序揭向人们展示了极端环境对基因组结构的限制，这项研究于八月十二日发表在Nature Communications杂志上。不能飞的南极蠓是目前基因组最小的昆虫，但它却具有差不多13,500个功能基因。南极蠓基因组之所以那么小，是因为它的内含子很短，而且重复序列和转座元件稀少。“我们感兴趣的是，其他极端环境生物（南极的扁虱、螨虫等）的基因组是不是也这么特别，”文章的共同作者，俄亥俄州立大学的David Denlinger教授说。研究人员指出，在南极蠓中热激蛋白、抗氧化酶、水通道蛋白的表达模式很独特。正是这些适应性改变帮助南极蠓在严酷的环境条件下生存下来，在那里干燥、严寒和高紫外线辐射是家常便饭。“这是首次测序极端环境下的昆虫，为以后的比较研究奠定了基础，”华盛顿州立大学的Joanna Kelley说。“此前有研究认为，有效群体大小越小基因组就越大，但我们看到南极蠓正好与此相反。”

种属：西部锦龟（Chrysemys picta bellii）基因组：~2.6 billion bp西部锦龟是北美最普遍的本地龟，它具有一些非凡的特性。西部锦龟可以在几乎冰冻的情况下存活，当它在冰封的池塘中冬眠时还会停止呼吸，等到早春再苏醒。研究人员对西部锦龟的基因组进行了测序，发现它耐受缺氧和寒冷的能力，来自于脊椎动物的常见基因。他们通过转录组分析发现，在低氧条件下，大脑内19个基因和心脏内23个基因的表达显著增加。

种属：非洲腔棘鱼（Latimeria chalumnae）基因组：~2.86 billion bp人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝，直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年前的化石差不多，因此也被称为“活化石”。研究人员测序了腔棘鱼的整个基因组，发现其蛋白编码基因变化很小。化石研究显示，腔棘鱼的四个鳍逐渐转变成为动物的四肢。研究人员将腔棘鱼的基因组与四足脊椎动物进行比较，鉴定了大量二者共有的调控DNA，而这些DNA是普通鱼类不具备。他们将上述序列插入小鼠胚胎，启动了一系列基因的表达，这些基因与手腕、脚踝、手指和脚趾的骨形成有关。

Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome

总结

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