RNA测序可靠性如何？

RNA测序也就是所谓的RNA-seq，通常指的是转录组测序，只测细胞中的转录本，只有基因组中被转录出来的那部分能测到，通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。DNA测序是测基因组，不管转录不转录，通常用于基因组组装，重测序进行基因分型等。相对而言，RNA测序影响准确度的因素要多一些。

DNA测序是将RNA反转录成DNA然后测序，在反转录的过程中会存在一定小概率的错配、缺失等。 转录组测序主要通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA。

最近，由美国FDA牵头的测序质量控制（SEQC）项目对RNA测序的准确性、可重现性和信息含量进行了综合性评估，并将初步调查结果发表在近日的Nature Biotechnology杂志上。研究人员发现，所有测序深度都会出现未注释的外显子-外显子连接区域，其中80%以上都得到了qPCR的验证。用RNA测序检测相对表达可以得到准确且可重复的结果，但RNA测序和芯片都不能提供精确的绝对测量，而且研究用到的平台都存在基因特异性的偏好，包括qPCR。数据分析的算法也会对RNA测序产生很大影响，不同算法生成的转录本数据差异很大。

整体来说还是可靠的，虽说会有些许错配但是不会太影响。如果与DNA测序相比，还是有所不如的~

总结

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